MedDRA的asc文件的SAS读取

Zhen Lu
Jan 10, 2024 2 min read 生物统计, SAS, MedDRA

问题

起因是，有同学在小红书上提问，怎么用SAS读取MedDRA的asc文件。

提问

那我们这篇文章就在不使用MedDRA Desktop Browser (MDB)前提下，用SAS实现一下。

MedDRA

首先，还是介绍下MedDRA，MedDRA是Medical Dictionary for Regulatory Activities的缩写，是由国际药品监管机构协调委员会（International Council for Harmonisation of Technical Requirements for Pharmaceuticals for Human Use，简称ICH）制定的一套医学术语词典，用于药物不良事件（Adverse Event，简称AE）的记录、报告和分析。其旨在支持全球药物和医疗器械的监管和研究。该词典提供了统一的医学术语体系，用于描述和报告与药物治疗相关的医学事件和药物副作用。

MedDRA的主要特点：

  • 全球标准化： MedDRA是全球性标准，被世界范围内的药品监管机构采用，包括美国FDA、欧洲药物管理局（EMA）等。
  • 多语言支持： 以多语言形式提供，促进全球卫生专业人员、研究人员和监管机构之间的有效沟通。
  • 层次化结构： 采用层次化的术语结构，从高层次的系统性术语到更具体的事件术语，为不同层次的用户提供了灵活性。
  • 定期更新： MedDRA定期进行更新，以反映新兴的医学知识和新药物的开发。

MedDRA的术语结构如下图所示：

MedDRA

asc文件

我们拿到的MedDRA文件一般是asc文件，其格式如下：

asc

这里我们拿到的是最新的26.1中文版本MedDRA。

如果不用SAS读取，在MDB中显示如下：

mdb

SAS读取

我们可以用SAS的infile来读取，首先导入SOC/HLGT/HLT/PT hierarchy文件，如下：

data mdhier_&dsver.;
        infile "&path.\mdhier.asc" dsd dlm='$' missover lrecl=32767;
        length pt_name 
               hlt_name 
               hlgt_name 
               soc_name $100 
               soc_abbrev $5 
               null_field $1
               primary_soc_fg $1;
          input pt_code 
              hlt_code 
              hlgt_code 
              soc_code 
              pt_name 
              hlt_name 
              hlgt_name 
              soc_name
              soc_abbrev 
              null_field 
              pt_soc_code 
              primary_soc_fg;

        length ver $4;
        ver = left("&ver.");
        aebodsys = upcase(soc_name);
        aedecod = upcase(pt_name);
    run;

然后再类似地分别导入PT、LLT level文件，再将二者通过pt code merge起来，最后再将SOC/HLGT/HLT/PT level文件merge起来。

最终输出的文件如下：

output

这就拿到了我们想要的文件，也就解决了小红书那位同学的问题。

完整的SAS宏代码我已经放进了星球里，感兴趣的同学可以去看看。

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Zhen Lu
Zhen Lu
Biostatistician, Clinical Epidemiologist

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